109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1460 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  68.67 
 
 		 86 aa  130  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.42 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  52.05 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  52.7 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.52 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  46.75 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.15 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  48.05 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  52.17 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  46.75 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  47.95 
 
 		 73 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  49.28 
 
 		 73 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  50.72 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  46.38 
 
 		 73 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  40.54 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.97 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  47.95 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  42.31 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  39.73 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.89 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  46.38 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  43.84 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  35.06 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  35.06 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  35.06 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.11 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.11 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.11 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  44.12 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  39.73 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  42.47 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  39.73 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  41.67 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  43.42 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  41.1 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.84 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  40.58 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  43.06 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  37.14 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.91 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  41.79 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  32.86 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  32.86 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  38.46 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  39.29 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  39.19 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.77 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  42.19 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.99 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  39.74 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  39.74 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  40.68 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  30.88 
 
 		 81 aa  48.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0095  glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0141921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  34.62 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  43.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  34.38 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  40.38 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  37.29 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  30.67 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  29.23 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  29.23 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  37.29 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  30 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  32.79 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  30.26 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  29.49 
 
 		 384 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  34.55 
 
 		 80 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.09 
 
 		 81 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  35.09 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.73 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  33.33 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  28.99 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  31.15 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  31.15 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  24.19 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  29.23 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  32.79 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>