113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1785 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
83 aa  173  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  72.15 
 
 
80 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  73.08 
 
 
80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  70.67 
 
 
94 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  67.11 
 
 
86 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  68.83 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 
86 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  68 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  61.04 
 
 
93 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  65.33 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 
86 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 
92 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  60.76 
 
 
79 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 
91 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  58.67 
 
 
78 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 
83 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 
83 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  58.23 
 
 
79 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
89 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  55.26 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  53.95 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  53.09 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  52.56 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  50.67 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  63.16 
 
 
84 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  38.67 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  39.02 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  47.46 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  42.37 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  34.72 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  35.14 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  32 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  44.83 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  33.78 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  37.33 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  29.87 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  29.73 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.21 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  35.48 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  30.77 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.87 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  36.07 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  36.21 
 
 
384 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  47.83 
 
 
391 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.3 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  27.54 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.76 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  29.31 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.3 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.3 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  31.15 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.76 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  34.55 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  34.55 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  33.33 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  40.38 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.51 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.51 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  30.51 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  37.78 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  37.97 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  37.93 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  44.44 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  34.48 
 
 
402 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  31.03 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  32.76 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  32.76 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  35.19 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  31.82 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  42.22 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  36 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  29.31 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  31.48 
 
 
84 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  40.74 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  31.48 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  40 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>