164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5740 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  54.05 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  50 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  36.25 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  39.19 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  41.03 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  38.81 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  44.87 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  36.36 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  33.8 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  27.63 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36.36 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  46.97 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  33.82 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.93 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  32.47 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  38.36 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  36.21 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40.98 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  38.1 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  33.8 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  30.16 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  27.63 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  30.88 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  41.38 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  28.12 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.7 
 
 		 384 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  37.29 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  33.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  35.38 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  37.29 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  26.56 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  38.1 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  30.16 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  26.92 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.31 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  35.9 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  27.85 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  30.51 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  31.25 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  33.9 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  35.59 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  35.59 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  35.09 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  36.92 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.94 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  30.51 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3268  glutaredoxin  30.49 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  36 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  30.51 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30.67 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  32.2 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4588  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.67 
 
 		 567 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  32.2 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  35.38 
 
 		 391 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  34.38 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  46.51 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  30.51 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  28.57 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>