192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1772 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
89 aa  182  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  61.18 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  61.25 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  60.26 
 
 
86 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
85 aa  105  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 
86 aa  103  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  61.33 
 
 
87 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 
83 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
83 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  58.02 
 
 
82 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  58.02 
 
 
82 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  58.23 
 
 
83 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  58.02 
 
 
82 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  56.79 
 
 
92 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  55.7 
 
 
80 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  56.25 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  55.84 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  53.16 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  57.33 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  54.55 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  51.25 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  57.14 
 
 
84 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
79 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  57.53 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  42.11 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  63.27 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  36.25 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  47.54 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  45.31 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.51 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  45.76 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  32 
 
 
81 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  35.06 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  36.11 
 
 
74 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  44.62 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.66 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  51.35 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
95 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  33.33 
 
 
83 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  47.37 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  39.66 
 
 
90 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  38.98 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  38.57 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  42.62 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  46.43 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  39.66 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.92 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  48.65 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.28 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  31.82 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  34.48 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  31.33 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.33 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  50 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  40.74 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  38.71 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  36.92 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  48.57 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  35.09 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  40.74 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  41.82 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 
142 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.74 
 
 
175 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  36.67 
 
 
87 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.71 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  35.71 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  46.81 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  35.14 
 
 
229 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  35.71 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  36.67 
 
 
87 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.08 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  34.43 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.43 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  40 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  32.81 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.98 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.18 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  50 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>