More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0127 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  100 
 
 		 91 aa  191  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  58.82 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  59.04 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  57.32 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  57.32 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  58.54 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  56.25 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  56.47 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  50 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  53.85 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  50 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  51.72 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  51.85 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  47.73 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  52.94 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  51.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  50 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  51.22 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  51.22 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  45.88 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  50 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  48.24 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  48.81 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  48.81 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  48.19 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  46.59 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  46.43 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  46.59 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  50 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  50.59 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  47.56 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  51.85 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  49.38 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  50 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  49.41 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  47.56 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  45.57 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  49.38 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  46.34 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  44.3 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  45.57 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  43.68 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  45.68 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  45.68 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>