88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2413 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  100 
 
 		 126 aa  256  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  82.47 
 
 		 123 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  61.48 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  54.92 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  57.66 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.71 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  34.02 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  42.86 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40.91 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  34.88 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  28.8 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  36.36 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  41.79 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  33.33 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.73 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  39.74 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  34.33 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.8 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  37.31 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.76 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.77 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  28.41 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  35.62 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  36.99 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  29.41 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  37.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  35.06 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  35 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.78 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.78 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  31.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  30.88 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  35 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.613757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  28.95 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  30.49 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  32.89 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  36 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  32.89 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  31.51 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.9 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.59 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  36.23 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.59 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  28.89 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  31.51 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  31.88 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  32.5 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  29.85 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.33 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  28.36 
 
 		 86 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  33.33 
 
 		 221 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  34.78 
 
 		 78 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  34.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  34.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  34.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.56 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  31.58 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  34.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  36.21 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  27.06 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  35 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  30.49 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  28.4 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  34.78 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  29.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>