36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2412 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 76 aa  160  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  72.37 
 
 		 76 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  72 
 
 		 77 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  71.23 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  71.62 
 
 		 75 aa  120  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  50.68 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  47.95 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  28.99 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  29.58 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.05 
 
 		 383 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  29.33 
 
 		 391 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  27.63 
 
 		 384 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  27.63 
 
 		 402 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  28.79 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  30.88 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  30.16 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  30 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.25 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  36.21 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  27.54 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  25.68 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  25.71 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.17 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.34 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  33.82 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  34.21 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  32.86 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  33.82 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  31.34 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  29.17 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  29.49 
 
 		 85 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>