138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1264 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  100 
 
 		 70 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  94.29 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  85.71 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  50.77 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  51.47 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  51.67 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  44.62 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  42.86 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  39.13 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  41.18 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.76 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.88 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  30.99 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  40 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  34.43 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  37.1 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  38.33 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  33.96 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  40 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  43.1 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  42.62 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  36.67 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  36.54 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.14 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  48.57 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  27.14 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  36.92 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  35.38 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  27.14 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.43 
 
 		 383 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  27.87 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  37.31 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  33.85 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  51.61 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.88 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  27.69 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  30.16 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.26 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.38 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  31.51 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  28 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.51 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  34.67 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  30 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  30 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  30 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  30 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  27.87 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.43 
 
 		 384 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.81 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  33.9 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  33.9 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  34.62 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  27.42 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  35.82 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  32.84 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  35.82 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  28.79 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  35.38 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  30 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  34.62 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  35.38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  38.46 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  26.15 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  26.53 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  27.87 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  30 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  26.23 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  26.23 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  45.16 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  30.77 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  31.51 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  27.87 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  34.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>