41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003681 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  100 
 
 		 76 aa  157  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  95.89 
 
 		 75 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  87.67 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  83.56 
 
 		 75 aa  133  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  72.37 
 
 		 76 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  52.7 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  48.65 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  38.46 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  39.74 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  39.74 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.77 
 
 		 383 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  37.1 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  35.38 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  37.5 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32 
 
 		 391 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  34.78 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  28.77 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  26.67 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  30.77 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  35.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  25.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  36.21 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  29.85 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  25.33 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  24.69 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.32 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  29.58 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  26.87 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.85 
 
 		 398 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 125 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  25 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  31.88 
 
 		 442 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.78 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  23.61 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  22.97 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  23.61 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.29 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>