122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0640 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  100 
 
 		 75 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  67.57 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  54.79 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  52.7 
 
 		 76 aa  94.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  50.67 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  50.68 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  50.68 
 
 		 76 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  40.58 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  36 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  42.86 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  35.94 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  32.39 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.89 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  34.43 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  37.33 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  35.06 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.33 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.43 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.26 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32.47 
 
 		 391 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.51 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.94 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32.88 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  36.76 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  37.7 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  27.4 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  34.57 
 
 		 395 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  31.65 
 
 		 383 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  36.76 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.84 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  32.81 
 
 		 311 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  38.57 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  38.57 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  37.88 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  30.3 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  29.41 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  29.31 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  29.41 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  29.03 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  27.4 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  26.25 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  32.35 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1708  glutaredoxin  31.03 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.84 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  30.16 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  30.88 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  30.88 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  30.26 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  31.34 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  33.85 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  30.88 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2810  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  30.88 
 
 		 75 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  30.88 
 
 		 75 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  26.32 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.35 
 
 		 84 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  28.36 
 
 		 92 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  29.41 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  38.46 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  26.76 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  38.46 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  30.14 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  28.79 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>