118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3678 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  48.65 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  50.72 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  49.3 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  42.67 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  45.07 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  51.67 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  47.22 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  36.71 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.5 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.88 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  30.12 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  34.67 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  32.94 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  35.62 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  37.66 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.18 
 
 		 384 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.49 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  38.03 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  33.77 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  29.17 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  32.58 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  35.62 
 
 		 402 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  28.77 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  31.43 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  29.85 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  29.27 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  30 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  45.65 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  30.51 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  25.35 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  25.68 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  27.03 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  28.79 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.78 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.82 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.78 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  34.57 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  29.49 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  26.03 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01245  hypothetical protein  27.66 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  30.56 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  30.88 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  32.43 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  31.51 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  34.29 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.94 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  29.58 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  28.17 
 
 		 266 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  31.33 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  30 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  31.4 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  35.59 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  26.56 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.78 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  36.76 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  38.64 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  25.35 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  22.54 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  29.58 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  29.73 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  26.32 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  25.35 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  26.87 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  27.78 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 85 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  36.67 
 
 		 83 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  29.41 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  41.07 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.03 
 
 		 459 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  31.43 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 85 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0860  hypothetical protein  28.38 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  39.29 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  28.21 
 
 		 395 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  25.35 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  29.58 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  29.58 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  29.58 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  26.87 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>