77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0714 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
91 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  78.95 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  65.79 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  60.24 
 
 
88 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  65.79 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  61.73 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  60.49 
 
 
85 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  62.16 
 
 
86 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  60.24 
 
 
86 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 
81 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 
83 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  60.76 
 
 
82 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  56.96 
 
 
80 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 
79 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  52.81 
 
 
93 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  60 
 
 
83 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  53.09 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  59.46 
 
 
80 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  53.16 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  56 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  56 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  56.58 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  51.9 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  51.25 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  54.67 
 
 
78 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  64 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  52.63 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  54.79 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 
79 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  39.47 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  43.59 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  38.46 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  51.72 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  38.96 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.33 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  37.21 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  28.75 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32.05 
 
 
83 aa  57.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  38.27 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  34.18 
 
 
86 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  33.33 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  40.24 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  42.37 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  28.74 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  33.75 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  25.68 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  36.67 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  40 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  30 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  28.21 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  30.51 
 
 
85 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.33 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  30.56 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  32.84 
 
 
229 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.03 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  35 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  30.34 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  30.16 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  33.87 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  28.81 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  33.33 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  42.86 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  27.42 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  35.44 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  35.94 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  31.33 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  32.31 
 
 
85 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>