32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2739 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  58.82 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  62.2 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  55.56 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  58.75 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  49.37 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  46.99 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  51.95 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  57.14 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  43.75 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  44.68 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  47.06 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  46.99 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  45 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  44.3 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  43.21 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.4 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  32.93 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  34.34 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  24.39 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  24.19 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  28.21 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  26.51 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  28.4 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  34.78 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  32.91 
 
 		 260 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 77 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 77 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>