23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0198 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  84.62 
 
 		 91 aa  163  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  85.71 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  53.85 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  52.87 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  51.14 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  52.81 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  48.31 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  55.26 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  48.75 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  45.78 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  46.91 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  47.44 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  43.75 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  42.31 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  46.38 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  27.91 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  39.29 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  38.98 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.11 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>