21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2455 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  60.92 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  60.92 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  60.23 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  53.85 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  52.75 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  51.69 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  54.55 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  53.16 
 
 		 85 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  46.15 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  43.9 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  46.15 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  47.56 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  46.99 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  50 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.05 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  34.52 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.59 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>