22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0832 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  100 
 
 		 92 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  60.23 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  55.68 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  52.87 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  51.72 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  56.32 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  50.57 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  50 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  58.44 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  44.58 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  46.84 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  45.68 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  46.34 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  44.68 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  41.25 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  41.18 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  37.31 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 102 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  31.65 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>