26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2431 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  100 
 
 		 103 aa  213  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  60.92 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  55.68 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  53.41 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  51.14 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  52.27 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  49.43 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  50 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  52.5 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  48.72 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  48.75 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  50.65 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  47.56 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  45.24 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  49.33 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  44.3 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  32.5 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.25 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.18 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  30.86 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  28.74 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  36.62 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  29.63 
 
 		 80 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>