32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0501 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  100 
 
 		 92 aa  191  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  60.92 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  56.32 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  51.69 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  54.02 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  49.43 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  48.31 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  58.44 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  48.31 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  47.5 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  48.72 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  48.78 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  46.25 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  43.9 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  49.35 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  46.99 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  27.38 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.91 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.38 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  29.11 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  32.5 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  26.83 
 
 		 102 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>