18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2101 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  66.25 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  55.56 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  50.6 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  52.56 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  52.5 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  55.26 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  53.42 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  53.16 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  48.75 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  47.44 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  44.71 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  47.44 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  46.25 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  45.68 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  44.87 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.26 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  30.77 
 
 		 74 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>