38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1406 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  100 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  60.76 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  62.2 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  63.89 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  56.96 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  53.85 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  52.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  50.65 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  48.75 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  52.63 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  48.15 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  46.15 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  46.91 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  47.5 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  46.91 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  41.25 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  30.12 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  30.77 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  29.27 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  27.38 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  28.21 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  33.75 
 
 		 398 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  28.75 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  28.95 
 
 		 391 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  26.92 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  30 
 
 		 582 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  28.21 
 
 		 383 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  30 
 
 		 87 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  29.49 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  29.11 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  30.88 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  25 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  33.9 
 
 		 79 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>