26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2933 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  100 
 
 		 87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  66.25 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  59.49 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  56.96 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  57.53 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  50 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  45.88 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  45.78 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  47.56 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  47.56 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  51.32 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  48.78 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  46.34 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  46.34 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  41.67 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  28.92 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.49 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.5 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  36.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  36.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  27.87 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  27.87 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  29.63 
 
 		 76 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.5 
 
 		 81 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>