25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0908 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  100 
 
 
93 aa  192  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  53.41 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  53.93 
 
 
91 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  51.69 
 
 
95 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  54.02 
 
 
92 aa  100  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  52.81 
 
 
91 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  50 
 
 
92 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  53.85 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  51.69 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  50 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  50.65 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  50 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  48.75 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  53.95 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  49.37 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  45.83 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.38 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  26.92 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  35.21 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  32.81 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.87 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  26.25 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  27.27 
 
 
80 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>