29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2968 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  53.85 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  55.7 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  53.85 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  50 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  48.75 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  43.9 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  44.58 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  50 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  50.65 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  50 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  45.24 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  44.71 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  43.9 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  47.06 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  27.27 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  31.65 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.77 
 
 		 384 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.41 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.11 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  28.21 
 
 		 383 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  27.06 
 
 		 80 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  26.92 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  29.11 
 
 		 398 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  27.06 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>