18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0928 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  58.44 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  58.44 
 
 		 92 aa  93.6  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  55.26 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  54.55 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  55.26 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  55.26 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  50.65 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  52.63 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  50.65 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  51.32 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  53.95 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  47.37 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  51.95 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  55.26 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  54.41 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  29.87 
 
 		 398 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  35.53 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>