25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0348 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  100 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  70.83 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  63.89 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  55.7 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  57.53 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  53.42 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  54.41 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  49.35 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  49.33 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  45.83 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  50 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  45.59 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  46.38 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  44 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  46.38 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  25.64 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.62 
 
 		 398 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.63 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.1 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  31.17 
 
 		 582 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>