44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0155 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  84.62 
 
 		 91 aa  163  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  86.81 
 
 		 91 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  52.75 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  51.72 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  51.69 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  53.93 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  52.27 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  55.26 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  45.88 
 
 		 87 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  48.15 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  47.44 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  42.31 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  43.21 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  45.59 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.74 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.11 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  50 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.78 
 
 		 227 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 80 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  32.43 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  32.43 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  36.14 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  27.16 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  31.25 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.11 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  34.25 
 
 		 223 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>