89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2812 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 133 aa  273  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  33.87 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.71 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  34 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  29.84 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.71 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.95 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  34.57 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  30.86 
 
 		 391 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  36.59 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  38.75 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  32.1 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  30 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  33.06 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  32.1 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  30.11 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.33 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  34.09 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  29.89 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.11 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  31.25 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  36.05 
 
 		 383 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  40.85 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  32.22 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.71 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  39.74 
 
 		 382 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  29.63 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.18 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  28.09 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  28.26 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  35.9 
 
 		 402 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  26.72 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  31.51 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.7 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  37.97 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  31.51 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  27.16 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  36.11 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  27.03 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  43.18 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  27.71 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  32.18 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  32 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  28.24 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  52.78 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  52.78 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 92 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.25 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  34.72 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  31.76 
 
 		 96 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  31.76 
 
 		 96 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  27.85 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  36.36 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  43.24 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  31.82 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  29.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  24.74 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  26.09 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  35.71 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  31.65 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  25.77 
 
 		 102 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>