188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0332 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  100 
 
 
86 aa  182  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  65.43 
 
 
81 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  54.24 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  48.68 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  55.17 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  42.67 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  48.61 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  48.39 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  47.54 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
86 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  44.16 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  46.58 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  52.46 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  42.31 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  41.1 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  40 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  42.37 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  43.1 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  47.46 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  47.27 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  44.07 
 
 
79 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  35.62 
 
 
78 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  41.07 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  35.44 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  36.21 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  53.06 
 
 
84 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  41.82 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  39.66 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  33.72 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  39.66 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  36.36 
 
 
86 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.5 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  32.14 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  44.44 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  33.75 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  42.59 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  40.74 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  33.9 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  38.33 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  33.9 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  40.68 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  43.4 
 
 
194 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  38.89 
 
 
77 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  40 
 
 
86 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  42.59 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  36.21 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40.74 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  38.89 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  31.03 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  40.98 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  36.36 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  36.36 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  37.04 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.75 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  35.19 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  35.19 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  37.04 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  40.74 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  35.19 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  40 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  44.19 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3268  glutaredoxin  35.71 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>