95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1033 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  98.77 
 
 		 81 aa  169  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 		 81 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  83.95 
 
 		 81 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  80.25 
 
 		 84 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  51.39 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  50 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  48.61 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  48.61 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  46.67 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  46.91 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  45.33 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.83 
 
 		 73 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.58 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  45.68 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  44.44 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  44.44 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  44.44 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  50.72 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  44.44 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.87 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.87 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.87 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  43.04 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  44.44 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  43.06 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  40.85 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  41.77 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.03 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  44.29 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.25 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  41.43 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  41.67 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.67 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  41.67 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.3 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  38.89 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.44 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.14 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.71 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  40 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  41.89 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.06 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.06 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  35.82 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  30.56 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  34.29 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  33.85 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0095  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0141921  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  36.36 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  25 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  29.85 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  34.38 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  35.94 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  25 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  38.1 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  32 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  29.87 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  34.38 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  31.75 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  37.93 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  31.25 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  31.46 
 
 		 89 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>