105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3808 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 86 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  68.6 
 
 		 86 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  73.08 
 
 		 82 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  67.47 
 
 		 94 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  68.83 
 
 		 93 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  65.38 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  64.71 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 80 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  62.67 
 
 		 78 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  59.76 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  60.24 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  60 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  59.21 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  66.22 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  58.02 
 
 		 83 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  50.62 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  58.11 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  66.67 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  57.33 
 
 		 85 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  58.9 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  50.62 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  43.42 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  37.8 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  47.22 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  50 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  43.42 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  33.78 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  34.18 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  34.62 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  31.94 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.89 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  27.63 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  35.62 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  34.67 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32.05 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  36.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  32.5 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  36.67 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  36.71 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  35.19 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  35.19 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  35.62 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  35.48 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  43.9 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  27.12 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  42.59 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  41.07 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  33.85 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  42.59 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  42.59 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  37.5 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.73 
 
 		 80 aa  42  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  35 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.73 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 91 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  35.71 
 
 		 84 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 		 194 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  31.03 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.75 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  39.53 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  29.87 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  30.36 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  39.39 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.93 
 
 		 249 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  29.82 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.09 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  31.75 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  33.93 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  31.75 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>