52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2760 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  100 
 
 
74 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
83 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  49.32 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  35.14 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  37.5 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36.11 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
89 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
85 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  34.72 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  38.36 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  31.94 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  40.28 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  32.88 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  33.33 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  36.99 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  32.14 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  34.38 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  25.68 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  25 
 
 
94 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  30.36 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0653  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
568 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  39.73 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  32.08 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  37.04 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2160  glutaredoxin  42.86 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3268  glutaredoxin  31.58 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  45.71 
 
 
90 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  38.89 
 
 
84 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  39.13 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  26.47 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>