More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46670 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  56.79 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  54.17 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  51.72 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  48.81 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  50 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.55 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  46.25 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  45 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  42.22 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  42.17 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  39.76 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  40.96 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  41.46 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  37.65 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  38.55 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  38.55 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  41.46 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  38.55 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  36.47 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  39.29 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  36.59 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  36.9 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  39.76 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  37.65 
 
 		 87 aa  66.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  38.55 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  36.9 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  35.37 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  38.82 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  39.76 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.55 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  40.91 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  40.24 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  37.65 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  38.55 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  34.15 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  32.14 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  40.24 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  29.41 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  37.21 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  38.55 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  41.98 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  39.29 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  38.1 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  31.71 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>