171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_56497 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  100 
 
 		 144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  40.95 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  42.72 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  37.62 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  43.01 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  42.22 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  34.26 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  31.07 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  31.37 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  35.87 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  33 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  33.68 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  32.97 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  33 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  34.04 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.78 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  34.04 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  36.56 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  32.61 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  32.98 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  32.61 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  35.42 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  30.85 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  32.26 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  32.61 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  32.26 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  30.53 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.88 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32.97 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  32.94 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  34.74 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  32.97 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  30.53 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  30.43 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35.23 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  30.43 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  30.85 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  29.79 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  30.85 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32.61 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  30.85 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  32.61 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  32.61 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  34.83 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.59 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  32.29 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  34.83 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  30.85 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  30.85 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  32.98 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  32.61 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  32.26 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  32.26 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  32.29 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  32.26 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  29.47 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  35.96 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  34.04 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  30.68 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  30 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  32.61 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  30.68 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  30.68 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  34.04 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  32.61 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  33.71 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  32.97 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  35.23 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  35.16 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  33.71 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  30 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  28.26 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  31.46 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  31.46 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  29.35 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  32.61 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  31.46 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>