288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43497 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  57.58 
 
 
105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  46.88 
 
 
104 aa  97.1  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  54.32 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  51.72 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  42.72 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  40.86 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  38.37 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  43.02 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  34.12 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  31.25 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  34.12 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  41.86 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  37.65 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  42.35 
 
 
85 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  34.44 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  42.35 
 
 
85 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  40.7 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
87 aa  61.6  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  38.82 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  38.64 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  38.64 
 
 
86 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  38.55 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  38.55 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  38.55 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  36.05 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
84 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  38.82 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  36.05 
 
 
83 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  37.65 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  34.52 
 
 
86 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  39.29 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40.7 
 
 
85 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.78 
 
 
85 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.78 
 
 
85 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  41.18 
 
 
87 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
85 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  37.21 
 
 
86 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  37.65 
 
 
84 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.71 
 
 
246 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  38.82 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  37.65 
 
 
85 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  36.78 
 
 
87 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  36.78 
 
 
87 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  40.95 
 
 
205 aa  58.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  36.9 
 
 
85 aa  58.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  35.71 
 
 
83 aa  58.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  32.58 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  37.35 
 
 
112 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  36.47 
 
 
85 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  38.64 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  31.25 
 
 
81 aa  57.4  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
84 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  35.23 
 
 
86 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  35.23 
 
 
86 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  35.23 
 
 
86 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05410  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 
382 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  35.23 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  34.94 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  36.05 
 
 
86 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  34.52 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  38.36 
 
 
243 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  38.36 
 
 
243 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  38.36 
 
 
243 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  34.94 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  36.9 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  36.9 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  38.55 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  37.21 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  36.05 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  36.14 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  34.12 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  34.52 
 
 
83 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  34.88 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  39.53 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  35.63 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  33.72 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  38.2 
 
 
91 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
84 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>