76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05410 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05410  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  784    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152877  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  38.38 
 
 		 205 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  43.59 
 
 		 104 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  38.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  39.51 
 
 		 86 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  34.12 
 
 		 104 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  40.85 
 
 		 102 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04660  glutathione transferase, putative  32.58 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09464  Glutaredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09090)  56 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  34.41 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03380  expressed protein  27.97 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  37.8 
 
 		 86 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  35.9 
 
 		 95 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  30.86 
 
 		 84 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  38.55 
 
 		 85 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.59 
 
 		 459 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  30.86 
 
 		 84 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  26.51 
 
 		 89 aa  49.7  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 85 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  31.25 
 
 		 91 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  30.86 
 
 		 84 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 85 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  33.67 
 
 		 90 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 85 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  30 
 
 		 87 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  28.24 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  30.86 
 
 		 84 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 84 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  28.4 
 
 		 81 aa  47.4  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  25.93 
 
 		 81 aa  47  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  32.58 
 
 		 86 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  31.71 
 
 		 80 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  33.75 
 
 		 85 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  33.75 
 
 		 85 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  32.94 
 
 		 92 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  28.4 
 
 		 84 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  28.4 
 
 		 84 aa  46.2  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  30 
 
 		 84 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  27.5 
 
 		 84 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 86 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 83 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  30 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  30.53 
 
 		 101 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  33.73 
 
 		 83 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 82 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 83 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 85 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 82 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  30.12 
 
 		 87 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  28.4 
 
 		 88 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  31.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  30 
 
 		 88 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  29.76 
 
 		 89 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  32.5 
 
 		 85 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>