196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37445 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  100 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  56.79 
 
 		 86 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  46.88 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  50.6 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  46 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  40.45 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_56497  predicted protein  37.62 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  42.67 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05410  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  38.2 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09464  Glutaredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09090)  40.68 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.52 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  37.18 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  34.52 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.95 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  40.24 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  32.1 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.95 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  30.43 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  30.43 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  31.46 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.48 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  34.15 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  32.93 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.48 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.14 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  35.14 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  29.76 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  34.12 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  34.18 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  30.68 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  37.97 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  36.05 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  31.4 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  31.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  31.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  35.8 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51837  predicted protein  35.21 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  31.17 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  40.26 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  37.18 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  32.94 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  29.55 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  37.18 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  32.93 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  24.75 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  28.05 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  24.75 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  36.25 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  31.65 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  29.55 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  32.1 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  32.1 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  32.94 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  33.73 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  35 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  34.18 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  34.57 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  32.18 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  31.33 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>