57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0413 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  63.53 
 
 
101 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  38.75 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  37.63 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  34.94 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  37.5 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  34.52 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 
94 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.51 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  35.71 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  35.62 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  29.73 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  32.1 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  32.47 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
80 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  38.03 
 
 
100 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  30.67 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  29.63 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  33.77 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4332  hypothetical protein  26.39 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  39.73 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  27.5 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  27.5 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32.1 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  31.15 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  36.67 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  29.87 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  26.92 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  28.4 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.67 
 
 
81 aa  42  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  39.66 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
83 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  24 
 
 
74 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  20.31 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  32.73 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  31.51 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.85 
 
 
391 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  34.48 
 
 
73 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  31.67 
 
 
81 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  31.17 
 
 
84 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4576  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.05 
 
 
553 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494559  normal  0.955166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  29.11 
 
 
80 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>