105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0934 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 79 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  87.34 
 
 		 79 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 		 80 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  60.53 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  60.76 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  60.81 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  55.84 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  57.14 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  56.76 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  56 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  52.63 
 
 		 83 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  52.7 
 
 		 83 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  52.7 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  48.68 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  48.68 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  48.65 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  43.24 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  48.72 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  49.35 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  43.59 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  51.32 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  35.71 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  47.46 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  36.49 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  40.79 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.33 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  35.53 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.1 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  35.14 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  37.5 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  40.68 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  43.4 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  43.64 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  38.57 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  35.71 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.89 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  38.18 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  29.89 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  36.07 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  35.59 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6889  thioredoxin-disulfide reductase  35.38 
 
 		 411 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  31.94 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  37.5 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.48 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  41.03 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 572 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  34.55 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5494  Thioredoxin-disulfide reductase  33.85 
 
 		 413 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.521231  normal  0.269198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  47.22 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  33.93 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  38.18 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  29.33 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  32.47 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  36.21 
 
 		 85 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  39.62 
 
 		 249 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 88 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  35 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  38.18 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  41.82 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  43.1 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  34.55 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  33.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  27.12 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  34.55 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  27.87 
 
 		 85 aa  40  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  32.14 
 
 		 85 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>