42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0606 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  100 
 
 		 97 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  37.23 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  37.63 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  42.11 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  34.33 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  30 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.72 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  32.18 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  28.74 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  34.21 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  36.21 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  32.5 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  29.89 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  31.82 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  37.66 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  30.34 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  29.55 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  31.34 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  27.59 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4332  hypothetical protein  29.21 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  33.77 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  32.08 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  29.07 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  37.74 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  26.44 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  26.44 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  32.86 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.24 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  36.21 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.82 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  27.42 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  29.31 
 
 		 85 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>