62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2665 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  61.45 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  40.96 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  45.57 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  54.05 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  37.35 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  49.32 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  44.74 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  37.97 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  38.16 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  41.07 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  34.57 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  34.94 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  34.25 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  37.84 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  37.84 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  37.84 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  32 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  32.89 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  42.11 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  32.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  40.68 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.1 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  26.32 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  34.57 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  32.76 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  44.44 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  37.04 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.81 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  32.14 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  38.98 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  42.59 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0147  glutaredoxin  36.21 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.500509  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  38.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  35.19 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.55 
 
 		 116 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  32.2 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 95 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  33.8 
 
 		 84 aa  40  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  33.82 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>