46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5178 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  45 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  38.75 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  37.21 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  37.21 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  35.9 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  38.89 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  45.76 
 
 
89 aa  60.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  39.51 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  35.44 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  39.13 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 
88 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  35.8 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  30.86 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  30.86 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  30.86 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  30.77 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  34.33 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  32.05 
 
 
84 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  31.51 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  34.52 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  32 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  40.51 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  35.09 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.71 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  27.85 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  30.59 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6889  thioredoxin-disulfide reductase  32.47 
 
 
411 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5494  Thioredoxin-disulfide reductase  32.47 
 
 
413 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.521231  normal  0.269198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3268  glutaredoxin  35.29 
 
 
106 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  31.58 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  35.71 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>