83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0749 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  47.44 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  50 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  49.35 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  47.37 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  47.37 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  47.37 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  48.05 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  42.11 
 
 
94 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  44.16 
 
 
88 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  45.33 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  43.42 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  44 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  44.16 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  50.67 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  41.56 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  44.74 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  42.47 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  42.11 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  39.74 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  38.67 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  39.73 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  42.11 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  44.74 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  41.03 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  35.62 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  36 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  40.28 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  36.84 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  32.76 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  35.09 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  35.38 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  42.62 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  30.49 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  31.15 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  33.77 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  32.79 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  35.94 
 
 
229 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  30.51 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  31.15 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  27.16 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  35.06 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  24.59 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  26.44 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  32.31 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  27.87 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  30.51 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  29.87 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  41.27 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  31.75 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  27.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  32.79 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  27.87 
 
 
85 aa  42  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  30.51 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  31.15 
 
 
86 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  28.81 
 
 
85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  28.81 
 
 
85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  27.87 
 
 
85 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  28 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  43.24 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.81 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  27.69 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4576  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 
553 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494559  normal  0.955166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.9 
 
 
74 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>