43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  52.5 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  53.85 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  51.95 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  47.37 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  44.16 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  44.16 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  46.38 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  40.24 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  43.24 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  40.22 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  43.94 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  40.54 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  44.62 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  40.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  43.24 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  42.65 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  40.26 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  42.65 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  43.94 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  39.19 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  35.59 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05960  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.586539  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  37.7 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  32.84 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  34.43 
 
 		 77 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  43.04 
 
 		 84 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>