88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3005 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
81 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
81 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
81 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
81 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  98.77 
 
 
81 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  85.19 
 
 
81 aa  153  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  83.95 
 
 
81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  83.54 
 
 
84 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  50.63 
 
 
80 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.91 
 
 
81 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  48.61 
 
 
99 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  48.61 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  51.35 
 
 
73 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 
73 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 
73 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.58 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  46.91 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  43.06 
 
 
73 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  45.83 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 
82 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  43.06 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  48.57 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  46.58 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 
74 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  45.83 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  48.61 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  49.28 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  46.48 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  43.06 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  43.06 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  43.06 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  45.71 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  45.21 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  43.06 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  43.06 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  39.44 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  43.06 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.66 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.74 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  50 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  46.58 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36.62 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.44 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.18 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.29 
 
 
72 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  38.89 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.31 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  39.71 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  38.89 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  33.77 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  33.77 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  33.33 
 
 
88 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  29.58 
 
 
75 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  37.5 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  39.06 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  36.51 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  25.35 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.95 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  38.18 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0095  glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0141921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  33.87 
 
 
213 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.86 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  27.59 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  27.59 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  30.65 
 
 
229 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  30.65 
 
 
221 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  30.65 
 
 
266 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>