More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4334 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  100 
 
 		 78 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  41.43 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.8 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32.39 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  34.72 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  39.13 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  39.47 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  32.39 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  34.72 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  38.57 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  30.99 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  29.58 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  29.58 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  39.44 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  38.89 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  28.17 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  37.14 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.21 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.21 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  31.58 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  36.11 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  36.36 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  37.88 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  32.39 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  37.84 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  36.11 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  36.11 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  35.06 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.92 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  37.68 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  37.18 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  37.18 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  35.71 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  37.14 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  35.71 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  38.1 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  33.77 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  34.72 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  35.62 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  35.71 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  29.58 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.51 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  31.58 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.68 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  37.5 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  29.17 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  34.72 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  34.72 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  31.51 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  32.88 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  34.78 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  32 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  37.18 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  32 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  28.77 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  35.53 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>