More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2713 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  89.26 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  86.78 
 
 		 242 aa  447  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  82.57 
 
 		 247 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  78.51 
 
 		 243 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  77.59 
 
 		 243 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  77.59 
 
 		 243 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  77.59 
 
 		 243 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  77.18 
 
 		 243 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  69.29 
 
 		 243 aa  370  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  70.46 
 
 		 238 aa  368  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  70.66 
 
 		 243 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  69.71 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  70.66 
 
 		 243 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  68.6 
 
 		 251 aa  357  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  67.92 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  68.18 
 
 		 259 aa  354  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  65.4 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  67.08 
 
 		 247 aa  340  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  63.49 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  62.81 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  61.57 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  61.57 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  63.49 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  63.49 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  64.88 
 
 		 243 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  63.64 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  63.07 
 
 		 248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  61.83 
 
 		 245 aa  324  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  59.17 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  60.71 
 
 		 174 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 176 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  58.82 
 
 		 175 aa  202  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  58.58 
 
 		 190 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.68 
 
 		 175 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  55.81 
 
 		 190 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  53.98 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  55.62 
 
 		 190 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  51.96 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  47.7 
 
 		 179 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  50.59 
 
 		 179 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  49.7 
 
 		 175 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  47.06 
 
 		 182 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  47.25 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  47.06 
 
 		 182 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  47.06 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  44.77 
 
 		 188 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 179 aa  154  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  49.68 
 
 		 159 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  46.88 
 
 		 160 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  43.27 
 
 		 184 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.59 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  45.86 
 
 		 159 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  47.13 
 
 		 157 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  45.28 
 
 		 157 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  43.4 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.33 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  42.5 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  42.41 
 
 		 160 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  44.65 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  42.04 
 
 		 157 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  43.4 
 
 		 157 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 157 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 157 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  46.34 
 
 		 161 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.12 
 
 		 158 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  44.94 
 
 		 161 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.04 
 
 		 157 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  45.73 
 
 		 163 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  40.25 
 
 		 162 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 178 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.31 
 
 		 157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  40.24 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  40.85 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  44.17 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.06 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  44.79 
 
 		 161 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  44.17 
 
 		 161 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  51.18 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50.38 
 
 		 168 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  41.57 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  41.57 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.72 
 
 		 161 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  50.38 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  41.1 
 
 		 161 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40.88 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  50.39 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  44.3 
 
 		 161 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  44.93 
 
 		 166 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.18 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  43.36 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  37.42 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.85 
 
 		 158 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>