220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3596 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  78.61 
 
 		 182 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  78.61 
 
 		 182 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  72.16 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  72.83 
 
 		 179 aa  277  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  70.72 
 
 		 188 aa  273  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  68.82 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  57.8 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 		 176 aa  227  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  59.76 
 
 		 189 aa  224  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  56.9 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  55.75 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  54.76 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  54.12 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  56.47 
 
 		 175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  55.03 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  54.97 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.95 
 
 		 175 aa  201  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  49.43 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  45.95 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  51.76 
 
 		 243 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  51.76 
 
 		 243 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  51.14 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  48.89 
 
 		 247 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  46.47 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  49.41 
 
 		 242 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  48.24 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  48.55 
 
 		 243 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  49.41 
 
 		 243 aa  167  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  49.41 
 
 		 243 aa  167  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  49.41 
 
 		 243 aa  167  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  48.82 
 
 		 248 aa  167  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  49.41 
 
 		 243 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  49.41 
 
 		 245 aa  166  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  47.98 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  46.07 
 
 		 243 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  46.78 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  45.88 
 
 		 247 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  48.82 
 
 		 246 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  45.88 
 
 		 247 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  47.65 
 
 		 243 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  47.06 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  47.06 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  47.16 
 
 		 242 aa  160  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  47.06 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  47.06 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  46.47 
 
 		 249 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  43.33 
 
 		 242 aa  154  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  43.53 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  48.99 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  39.18 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.96 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.35 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  44.16 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  42.11 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  44.37 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  43.51 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  40.57 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  40.57 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  44.16 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.31 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.28 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  43.33 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  44.67 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  45.21 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  38.6 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.97 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  43.14 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  43.36 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  42.67 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  43.97 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  37.71 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  42.95 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  42.95 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.26 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  42.95 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  44.14 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  40.79 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  36.21 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  41.56 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  51.35 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  40.91 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  42.59 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  42.21 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  41.84 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  40.91 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.48 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  41.56 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  40.91 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  43.48 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  43.57 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.48 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.48 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  44.7 
 
 		 214 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>