172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0141 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  72.61 
 
 		 158 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  71.34 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  71.34 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  71.34 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  71.34 
 
 		 157 aa  230  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  69.43 
 
 		 157 aa  230  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  70.7 
 
 		 157 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  70.7 
 
 		 157 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  70.7 
 
 		 157 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.06 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  71.52 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  70.7 
 
 		 178 aa  227  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  69.43 
 
 		 157 aa  226  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  68.79 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  67.72 
 
 		 158 aa  219  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  67.52 
 
 		 157 aa  217  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  65.61 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  60.51 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  59.24 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  52.23 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  51.9 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  58.21 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  52.83 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  53.12 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.96 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.04 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  53.01 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.22 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.99 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  56.49 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  48.8 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  48.8 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  47.88 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  47.88 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  48.8 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  49.09 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  48.1 
 
 		 160 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.48 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 		 185 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  48.8 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  55.88 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.39 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  49.08 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  57.94 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  46.39 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  46.39 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  47.27 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  50 
 
 		 174 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.39 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  46.39 
 
 		 214 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  46.39 
 
 		 214 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.06 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  46.39 
 
 		 214 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  53.03 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  44.23 
 
 		 259 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.39 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.39 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  46.2 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  46.39 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  46.39 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  47.88 
 
 		 192 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  46.79 
 
 		 243 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  47.85 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  46.79 
 
 		 243 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.99 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  46.2 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.79 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  46.1 
 
 		 242 aa  144  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  46.48 
 
 		 176 aa  144  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  54.41 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  44.23 
 
 		 251 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  46.54 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  48.57 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  44.87 
 
 		 249 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  52.24 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  52.24 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 243 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.96 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  52.55 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  51.49 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  55.12 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  46.72 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  48.25 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  53.9 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  46.54 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  50 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  50.31 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  47.22 
 
 		 247 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  51.47 
 
 		 238 aa  137  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>