More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4889 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  85.6 
 
 		 243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  72.31 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  72.31 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  68.88 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  69.01 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  69.42 
 
 		 242 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  65.84 
 
 		 259 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  64.73 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  63.79 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  68.46 
 
 		 247 aa  345  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  64.2 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  66.53 
 
 		 242 aa  337  7e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  63.9 
 
 		 245 aa  337  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  64.61 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  62.4 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.9 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  63.9 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.9 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  62.4 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  64.05 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  64.88 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  66.53 
 
 		 247 aa  328  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  63.9 
 
 		 243 aa  328  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  60.33 
 
 		 249 aa  327  9e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  62.4 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  64.32 
 
 		 246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  64.14 
 
 		 238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  59.5 
 
 		 242 aa  315  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  53.72 
 
 		 249 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  61.08 
 
 		 174 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  60.36 
 
 		 190 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  59.88 
 
 		 176 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  53.63 
 
 		 190 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  57.99 
 
 		 190 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  55.95 
 
 		 189 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 175 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  54.07 
 
 		 189 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.49 
 
 		 175 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  50.87 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  50.87 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  48.84 
 
 		 188 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  50.59 
 
 		 179 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  51.76 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  48.55 
 
 		 181 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  48.52 
 
 		 175 aa  165  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  50 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  53.25 
 
 		 159 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  45.98 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 		 179 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  48.41 
 
 		 157 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  46.25 
 
 		 160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.2 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  46.2 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.3 
 
 		 167 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.15 
 
 		 157 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  43.31 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  44.52 
 
 		 162 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  44.03 
 
 		 162 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.81 
 
 		 158 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  44.94 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  44.38 
 
 		 158 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 157 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.14 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  44.38 
 
 		 161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.94 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  52.21 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  43.87 
 
 		 157 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.23 
 
 		 157 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 157 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 157 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  45.68 
 
 		 160 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.21 
 
 		 157 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  45.45 
 
 		 161 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  43.59 
 
 		 157 aa  131  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  44.3 
 
 		 161 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 		 161 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  42.86 
 
 		 157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  43.64 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50.71 
 
 		 168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  48.15 
 
 		 157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  52.27 
 
 		 168 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  43.04 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  51.97 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  43.87 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  45.52 
 
 		 161 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  42.95 
 
 		 157 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  43.31 
 
 		 160 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  44.79 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  45.07 
 
 		 161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  49.26 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  42.04 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  51.16 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  50.78 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>