241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0683 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  61.11 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  60.25 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.76 
 
 		 167 aa  200  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  60.87 
 
 		 160 aa  200  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  59.63 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  55.9 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  57.14 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  57.76 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  57.14 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  56.52 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  57.14 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.39 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  55.9 
 
 		 161 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  57.76 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  55.9 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.28 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  55.28 
 
 		 161 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  56.52 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  55.09 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  55.28 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  56.97 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  55.09 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  55.9 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  53.61 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  52.8 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  55.28 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  54.72 
 
 		 159 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  52.66 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  53.42 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  53.89 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  52.41 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.04 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  54.72 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  55.76 
 
 		 168 aa  176  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  54.66 
 
 		 161 aa  177  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.47 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  54.04 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  54.04 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  58.13 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.81 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  53.94 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  51.85 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  53.94 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.55 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  52.8 
 
 		 160 aa  174  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  52.1 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.6 
 
 		 157 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  55.15 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  57.5 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  56.6 
 
 		 157 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.33 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.9 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  50.9 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  52.12 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  51.85 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  49.38 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  55.97 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  54.09 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  55.86 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  50.9 
 
 		 168 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.3 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.62 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  52.1 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  50.3 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  50.6 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  55.97 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.5 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.5 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  55.62 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  55.62 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  55.62 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  49.4 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  53.46 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  52.73 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  48.12 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  55 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  53.12 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50.9 
 
 		 168 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  48.45 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  50.3 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  54.09 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  54.37 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  53.12 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  54.72 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  51.52 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.8 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.4 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>